Inserciones en secuencias de proteínas para la taxonomía y filogenia de las familias Pseudomonadaceae y Moraxellaceae (Orden Pseudomonadales)

Resumen

Las familias Pseudomonadaceae y Moraxellaceae comprenden especies de gran relevancia para la Medicina, Agricultura y Biotecnología. Pseudomonas aeruginosa y Acinetobacter baumanii, por ejemplo, constituyen patógenos oportunistas responsables de numerosas infecciones nosocomiales. La familia Pseudomonadaceae incluye además a la bacteria fitopatógena Pseudomonas syringae y a la fijadora de nitrógeno Azotobacter vinelandii, ambas con impacto en la agricultura. A pesar de que Pseudomonadaceae y Moraxellaceae han sido ampliamente estudiadas, pocos estudios han estado dirigidos a la determinación de marcadores moleculares que distingan a sus miembros de otros grupos de bacterias. Los marcadores indeles (inserciones/deleciones) en secuencias de proteínas conservadas han sido utilizados para estudios taxonómicos y evolutivos en bacterias. En el presente estudio se analiza si las inserciones identificadas en proteínas altamente conservadas constituyen marcadores moleculares para estudios taxonómicos y filogenéticos en Pseudomonadaceae y Moraxellaceae. Se analizaron secuencias de proteínas relacionadas con la replicación y la reparación del ADN, obtenidas de bases de datos internacionales y alineadas con el programa ClustalX2. Se identificó una inserción de un aminoácido en la proteína ADN polimerasa I que distingue a las familias Pseudomonadaceae y Ventosimonadaceae, además de una mayor de 11 aminoácidos que soporta la monofilia de los géneros Psychrobacter y Moraxella. Mientras que la inserción de 5 aminoácidos en la proteína ADN polimerasa (subunidad alfa) es distintiva de la familia Moraxellaceae. Las inserciones evaluadas constituyen marcadores moleculares útiles para abordar la taxonomía de Pseudomonadaceae y Moraxellaceae, y proveen de herramientas para estudios filogenéticos y la identificación molecular de bacterias incluidas en estas importantes familias.